A küldöttgyűlés a DOSz legfőbb döntéshozó szerve a küldöttgyűlés, amely dönthet minden más szerv hatáskörébe tartozó kérdésben is.
A küldöttgyűlés szavazati jogú tagjai az intézményi doktorandusz önkormányzatok elnökei, akik akadályoztatásuk esetén, amennyiben az intézményi alapszabály rendelkezik róla helyettesíthetők.
A küldöttgyűlés tanácskozási jogú, állandó meghívottjai:
- a felügyelő Bizottság tagjai,
- a Magyar Rektori Konferencia elnöke,
- a Magyar Felsőoktatási Akkreditációs Bizottság elnöke,
- az Országos Doktori Tanács elnöke,
- a Hallgatói Önkormányzatok Országos Konferenciájának elnöke,
- a Magyar Doktorandusz Közösség elnöke.
A küldöttgyűlés kizárólagos hatáskörei:
- az alapszabály elfogadása és módosítása,
- a költségvetés megállapítása és módosítása, az előző évi költségvetési beszámoló elfogadása,
- az elnök és az elnökhelyettesek, az elnökségi tagok valamint a felügyelő bizottsági tagok megválasztása és visszahívása,
- az elnökség éves beszámolójának elfogadása,
- állandó és eseti bizottság(ok) létrehozása,
- a tisztségviselők díjazásának megállapítása,
- dönt jogszabály által hatáskörébe utalt egyéb kérdésekben.